虽然SSD比磁盘技术似乎有巨大的优越性，但是也存在着一些缺点。首先它的价格昂贵，因为内存的花费差不多是磁盘存储的100倍。其次，它们通常由易失型DRAM组成，一旦断电，数据将永久地丢失。为了避免数据丢失，SSD应该采用后备电池保护。最后，因为SSD并不是缓存，因此，它不是将少量的数据块刷新到非易失存储，而是将SSD的整个内容进行拷贝。虽然对于目标磁盘驱动器或子系统，其容量及持续写的传输率也不尽相同，但对这个操作的合理估计是1GB /min。
其管理方法之一是使用磁盘驱动器来镜像SSD，然而，处理镜像驱动器的I/O却需要额外的开销，这就对SSD的整体I/O传输率产生负面影响。但无论如何，至少在完成到镜像磁盘的镜像写操作中，它所花费的时间是极小的。
由于某些原因，包括芯片密度、散热性能等，SSD的容量总是小于磁盘驱动器。当考虑到磁盘子系统时，容量差别更是巨大。这意味着使用SSD的应用要受到SSD的存储容量的限制。然而，值得指出的是，SSD可以用在磁盘子系统中以提供高性能的存储。
综上所述，较高的售价阻碍了SSD固态硬盘的普及，价格高于同容量的机械硬盘几倍甚至几十倍。目前的SSD固态硬盘的容量较小，和目前动辄500GB甚到上TB的硬盘，而SSD固态硬盘最高容量仅为128GB。缺乏终端设备的支持也是SSD固态硬盘所面临的另一大问题。
虽然目前固态硬盘还受着成本、容量等因素的制约，但是随着Vista操作系统的普及，SSD固态硬盘的规格不断升级以及发展速度将进一步加快，SSD固态硬盘明天会依然灿烂。
